если на xfce еще сидишь, то чтобы иконки яркие были а не эскизы страничек: запускаешь Thunar - Правка (верхнее меню) - Параметры. во вкладке отображение выбираешь "никогда" в строчке "показывать эскизы".
по пустым папкам - "Создать каталог...". Наверное я не правильно понял проблему.
на счет "создать документ" из меню пкм: в домашнем каталоге есть папка "Шаблоны". Достаточно накидать туда необходимых шаблонов (например сохранить пустой файл с разрешением .doc или .docx, назвать например "создать пустой документ Microsoft Word"). У меня работает. Только что проделал такие действия. Самому необходимости не было.