В системе сканер определяется ( команда lsusb его прекрасно видит),однако сканировать он отказывался.
В мэнеджере программ установил SANE, после этого следовал инструкциям отсюда: http://gettoknowlinux.blogspot.ru/2009/05/ubuntu.html
После установке SANE в usr/share появилась одноименная папка, открыл её с правами root, создал в ней папку gt68xx и скопировал скачанный файл прошивки A2Nfw.usb .
После всех этих манипуляций сканер заработал!