Как было сказано в конце предыдущей темы, я решился на переустановку системы, чем и избавился от непонятного файла Databases.db в домашнем каталоге.
Сегодня он появился в свежеустановленной ОС (та же Mint 17.3 Rosa KDE 64-bit) снова с временем изменения 08:20; в системном журнале ничего подозрительного около этой временной отметки не заметил (хотя я и не являюсь спецом по просмотру системных журналов). В это время компьютер был подключен к Интернету, мог использоваться FF или Kontact, или выполняться настройки рабочего стола. Загрузка компьютера была выполнена в 07:16.
До этого предыдущая загрузка завершилась не без проблем: я вызвал из KDE завершение сеанса, но процесс завис и я перешел по Ctrl+Alt+F1 в консоль и оттуда перезагрузился по sudo shutdown -r now.